Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SncaO55042 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SncaO55042 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SncaO55042 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SncaO55042 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SncaO55042 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SncaO55042 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SncaO55042 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SncaO55042 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SncaO55042 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SncaO55042 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SncaO55042 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SncaO55042 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SncaO55042 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SncaO55042 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SncaO55042 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SncaO55042 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SncaO55042 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SncaO55042 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SncaO55042 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SncaO55042 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SncaO55042 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SncaO55042 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SncaO55042 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SncaO55042 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SncaO55042 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SncaO55042 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SncaO55042 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SncaO55042 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SncaO55042 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SncaO55042 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SncaO55042 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SncaO55042 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SncaO55042 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SncaO55042 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SncaO55042 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SncaO55042 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SncaO55042 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms