Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chil3O35744 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chil3O35744 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chil3O35744 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chil3O35744 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chil3O35744 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chil3O35744 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chil3O35744 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chil3O35744 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms