Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf6bO35451 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf6bO35451 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf6bO35451 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms