Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd2O35392 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Foxd2O35392 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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