Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna6O35345 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kpna6O35345 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna6O35345 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms