Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IfnabL7MTU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms