Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8720K9J7F4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8720K9J7F4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms