Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calhm3J3QMI4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm3J3QMI4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms