Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem200cJ3QK46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms