Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lcG5E8I7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lcG5E8I7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lcG5E8I7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lcG5E8I7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lcG5E8I7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lcG5E8I7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp17lcG5E8I7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lcG5E8I7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp17lcG5E8I7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp17lcG5E8I7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lcG5E8I7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lcG5E8I7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lcG5E8I7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lcG5E8I7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lcG5E8I7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms