Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NpcdF8VQB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NpcdF8VQB8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms