Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5830473C10RikF8VQ07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5830473C10RikF8VQ07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms