Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ercc6F8VPZ5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Ercc6F8VPZ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ercc6F8VPZ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ercc6F8VPZ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms