Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700056E22RikF7CNM6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700056E22RikF7CNM6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms