Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5218F6YH22 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5218F6YH22 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms