Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8247F6VRJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8247F6VRJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms