Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21977F6U3N7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21977F6U3N7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21977F6U3N7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21977F6U3N7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21977F6U3N7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms