Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh18E9Q9Q6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh18E9Q9Q6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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