Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc146E9Q9F7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc146E9Q9F7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms