Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col22a1E9Q7P1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col22a1E9Q7P1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Col22a1E9Q7P1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms