Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Arhgef5E9Q7D5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Arhgef5E9Q7D5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms