Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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