Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930426L09RikE9Q0N7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930426L09RikE9Q0N7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930426L09RikE9Q0N7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930426L09RikE9Q0N7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930426L09RikE9Q0N7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930426L09RikE9Q0N7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930426L09RikE9Q0N7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930426L09RikE9Q0N7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms