Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20425E9Q035 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm20425E9Q035 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms