Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc62E9PVD1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms