Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Soga1E1U8D0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Soga1E1U8D0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Soga1E1U8D0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Soga1E1U8D0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms