Protein–RNA interactions for Protein: D3YWE3

Vmn2r84, MCG21564, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r84D3YWE3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r84D3YWE3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r84D3YWE3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r84D3YWE3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms