Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmf1B9EKI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmf1B9EKI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmf1B9EKI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmf1B9EKI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms