Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CatipB9EKE5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CatipB9EKE5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CatipB9EKE5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms