Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms