Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr29B1ARI9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prr29B1ARI9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms