Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pm20d2A3KG59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms