Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc38A2VDH3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc38A2VDH3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc38A2VDH3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc38A2VDH3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc38A2VDH3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc38A2VDH3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms