Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931406B18RikA2RSL7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4931406B18RikA2RSL7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms