Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fibcd1A2AV25 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fibcd1A2AV25 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms