Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd60A2AMD2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd60A2AMD2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms