Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc27A2A6Q5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc27A2A6Q5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc27A2A6Q5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc27A2A6Q5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms