Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cc2d2bA0A286YDU8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Cc2d2bA0A286YDU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms