Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms