Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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