Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20792A0A087WRF5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20792A0A087WRF5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20792A0A087WRF5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms