Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700019A02RikA0A087WPV9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700019A02RikA0A087WPV9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms