Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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