Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfkbiaQ9Z1E3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfkbiaQ9Z1E3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms