Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Shcbp1Q9Z179 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shcbp1Q9Z179 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms