Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PapolbQ9WVP6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PapolbQ9WVP6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms