Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd6ipQ9WU78 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.3 ms