Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lhx6Q9R1R0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lhx6Q9R1R0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhx6Q9R1R0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhx6Q9R1R0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms