Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a3Q9QZS0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a3Q9QZS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms