Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a4Q9QZR9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a4Q9QZR9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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